En su más reciente artículo, el profesor Boyd analiza varios aspectos del origen y la descomposición de la materia orgánica en varios sistemas acuícolas.
Los alimentos acuícolas manufacturados, si se gestionan incorrectamente, pueden resultar en una demanda indeseable de oxígeno que puede reducir los niveles de oxígeno disuelto y causar contaminación a través de efluentes, y estrés a los animales cultivados.
Los estanques acuícolas acumulan materia orgánica de fertilizantes orgánicos, restos de micro-organismos producidos dentro del estanque, las heces de los animales criados y el alimento no-consumido. Claude E. Boyd, Ph.D., detalla las principales prácticas de gestión de la materia orgánica,