El manejo del oxígeno disuelto es el requisito más importante de la calidad del agua de los estanques acuícolas. La concentración de OD por debajo de 3 mg/L es estresante para el camarón.
Los cambios en la concentración atmosférica de dióxido de carbono deberían tener poco efecto en el aumento de la concentración de alcalinidad en los sistemas acuícolas. El cambio climático es una preocupación mayor en la acuacultura de agua dulce que
La abundancia de fitoplancton suele ser alta en estanques acuícolas debido a las altas concentraciones de nutrientes de los fertilizantes o aportes de alimentos.